| 株式会社菱化システムとして |
| 1987年 |
科学技術計算分野に進出 |
| 1997年 |
Chemical Computing Group(CCG)社代理店契約締結 |
| 1998年 |
SCM社代理店契約締結 |
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Gaussian社代理店契約締結 |
| 1999年 |
SciCo（現Materials Design）社代理店契約締結 |
| 2001年 |
COSMOlogic社（現Dassault Systèmes社BIOVIAブランドの一部）代理店契約締結 |
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AEON Technology社代理店契約締結 |
| 2002年 |
ChemInnovation社代理店契約締結 |
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CCG社製品東南アジア諸国への販売開始 |
| 2005年 |
Daylight社代理店契約締結 |
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Partek社代理店契約締結 |
| 2006年 |
Scienomics社代理店契約締結 |
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BioSolveIT社代理店契約締結 |
| 2014年 |
NEBION社代理店契約締結 |
| 2015年 |
Collaborative Drug Discovery社代理店契約締結 |
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Dotmatics社官公庁・大学向け代理店契約締結 |
| 2016年 |
Scilligence社代理店契約締結 |
| 株式会社モルシスとして |
| 2016年 |
株式会社モルシス設立 |
| 2017年 |
菱化システムより科学技術システム事業部のソフトウェア事業を承継 |
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Chemotargets社代理店契約締結 |
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MN-AM社代理店契約締結 |
| 2018年 |
本社を東京都中央区八丁堀に移転 |
| 2023年 |
MedBioinformatics Solutions社代理店契約締結 |
