概要
Daylight C.I.S.社製ソフトウェアは、in-silico 創薬および化学情報管理システムを構築するための開発用ツール群です。
データベースシステム
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THOR/Merlinサーバシステムと、それを利用するためのツールです。
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THOR system | 化学情報データベースの登録と参照 |
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Merlin system | 高速検索と探索的データ解析 |
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Database Management Package | データベースシステムの管理ツール(オプション) |
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Merlin Control Language | Merlin検索自動化用のスクリプト言語(オプション) |
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Reaction Package | 反応データベース機能(オプション) |
また、THOR/Merlinデータベースで利用可能なデータコンテンツも取り扱っています。
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ACD (Available Chemicals Directory™) |
48万件以上の重複のない、商業的に入手可能な化合物のデータベース (MDL) |
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MEDCHEM | LogPやpKaが測定されたものも含め、総数5万5000件以上の化合物のデータベース (BioByte Corp.) |
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SPRESI | 56万件以上の文献データから抽出された約380万件の化合物のデータベース (InforChem GmbH) |
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WDI (World Drug Index™) |
約8万件の医薬品・薬理活性化合物データベース (Derwent Publications) |
データ処理ツール
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データ処理ツールは、データベースシステムやツールキットの機能を補完し、より高度な機能を提供します。
以下のようなツールが含まれます。
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MOL/SD/RD形式、 |
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分子のフィンガープリントの生成 | ![]() |
互変異性体構造の生成 |
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各種分子記述子やClogP・CMRの計算 |
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Daylightソフトウェアの機能をウェブで利用するためのCGI |
など |
Webサービス
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Webサービスは、WebアプリケーションからDaylightソフトウェアの機能を利用するための、Javaで作成されたコンポーネント集です。
以下のようなコンポーネントが含まれます。
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与えられた化学反応(SMIRKS)に従ったSMILESの変換 |
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MOL/SD/RD形式、SMILES形式、TDT形式の相互変換 |
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分子記述子やClogPなどの物性推算値の計算 |
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分子構造の描画 |
など |
ツールキット
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ツールキットは、Daylightシステムへのインタフェースを提供する、C/C++/FORTRAN用プログラミングライブラリ群です。
DayCart
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DayCartは、OracleおよびPostgreSQLデータベースに構造情報の格納・検索機能を追加するカートリッジです。
各種資料
パンフレット
Daylight C.I.S.社ウェブサイト
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開発元であるDaylight C.I.S.社のウェブサイトもあわせてご覧ください。