Daylight C.I.S.社製ソフトウェア

概要

Daylight C.I.S.社製ソフトウェアは、in-silico 創薬および化学情報管理システムを構築するための開発用ツール群です。

データベースシステム

THOR/Merlinサーバシステムと、それを利用するためのツールです。

THOR system 化学情報データベースの登録と参照
Merlin system 高速検索と探索的データ解析
Database Management Package データベースシステムの管理ツール(オプション)
Merlin Control Language Merlin検索自動化用のスクリプト言語(オプション)
Reaction Package 反応データベース機能(オプション)

また、THOR/Merlinデータベースで利用可能なデータコンテンツも取り扱っています。

ACD
(Available Chemicals Directory™)
48万件以上の重複のない、商業的に入手可能な化合物のデータベース (MDL)
MEDCHEM LogPやpKaが測定されたものも含め、総数5万5000件以上の化合物のデータベース (BioByte Corp.)
SPRESI 56万件以上の文献データから抽出された約380万件の化合物のデータベース (InforChem GmbH)
WDI
(World Drug Index™)
約8万件の医薬品・薬理活性化合物データベース (Derwent Publications)

データ処理ツール

データ処理ツールは、データベースシステムやツールキットの機能を補完し、より高度な機能を提供します。
以下のようなツールが含まれます。

MOL/SD/RD形式、SMILES形式、TDT形式の相互変換
分子のフィンガープリントの生成
互変異性体構造の生成
各種分子記述子やClogP・CMRの計算
Daylightソフトウェアの機能をウェブで利用するためのCGI
など

Webサービス

Webサービスは、WebアプリケーションからDaylightソフトウェアの機能を利用するための、Javaで作成されたコンポーネント集です。
以下のようなコンポーネントが含まれます。

SMILESの正規化(canonical SMILESへの変換)
与えられた化学反応(SMIRKS)に従ったSMILESの変換
MOL/SD/RD形式、SMILES形式、TDT形式の相互変換
分子記述子やClogPなどの物性推算値の計算
分子構造の描画
など

ツールキット

ツールキットは、Daylightシステムへのインタフェースを提供する、C/C++/FORTRAN用プログラミングライブラリ群です。

DayCart

DayCartは、OracleおよびPostgreSQLデータベースに構造情報の格納・検索機能を追加するカートリッジです。

各種資料

パンフレット

Daylight C.I.S.社ウェブサイト

開発元であるDaylight C.I.S.社のウェブサイトもあわせてご覧ください。

関連製品

CBIS
研究情報共有システム
MOE
統合計算化学システム
BioSolveIT社製創薬支援ツール