データ解析
データ解析機能 ～シミュレーションデータを共通のツールで解析～
SciMAPSは、シミュレーションプログラムによらずスケールや手法に応じた共通のデータ形式でシミュレーションデータを読み込みます。共通形式のデータは解析ツールにより可視化されます。物性解析をする上でシミュレーションプログラムと連携して計算を行うことがあります。このような物性解析は、特定物性解析ツールとして提供されます。
基本解析ツール
TRAJECTORY ANALYSIS
分子シミュレーションの履歴から得られるデータを解析するツールです。平均二乗変位からの拡散係数計算、二体分布関数、回転半径、角度、二面角分布、自由体積、自由表面等、系の特性を解析します。得られた２つのプロパティをそれぞれX軸、Y軸に取ることで相関関数を計算することも可能です。
VISUAL PROPERTY ANALYSIS
分子軌道、電子密度、静電ポテンシャル等の等値面の視覚化、基準振動解析の結果のアニメーション表示や矢印による振動モードの表示等、得られた物性値の視覚化のためのツールです。付随して得られる物性値（状態密度、バンド構造、フォノン、IR/RAMANスペクトル、NMRスペクトル、誘電特性、光学特性）については同時にグラフ表示します。
MAPS INSPECTOR
分子構造やシミュレーション結果を比較、分析する多目的ツールです。列の非表示や行のフィルタリングをすることで、特定のプロパティを持つ分子や原子グループの選択を可能にします。選択した原子、分子のみ表示することで特定の構造を調べることが可能です。
DENSITY PROFILE ANALYSIS
X、Y､Zの軸方向、円筒方向、原点からの動径方向の分子の密度プロファイルを計算し、グラフ化します。
POROSITY ANALYSIS
結晶およびアモルファス周期系の空隙を分析します。 細孔とチャネルを特定し、最大細孔径と細孔径分布を計算します。
特定物性解析ツール
ReaxFF Analysis
結合の生成、開裂を取り扱うよう設計された力場ReaxFFとL AMMPSを利用して得られた計算結果を解析するツールです。シミュレーション中に生成、分解する分子種を解析し、その分子種の数の時間変化をグラフ化します。また、どのような反応が何回シミュレーション中に起こったかをグラフにすることで、反応中間体や反応経路に対する知見が得られます。燃焼、酸化、重合などの反応シミュレーションの結果を分析して、温度、圧力、組成などのさまざまな因子の影響を調べることができます。
Elastic Properties
L AMMPSを使用した分子動力学シミュレーションの結果から、応力/ひずみ曲線を調べ、高分子や固体のヤング率とポアソン比を計算するツールです。
