製品構成
GENEVESTIGATOR Professionalの概要
GENEVESTIGATOR Professionalは、NEBION社のサーバーにログインして使用するオンライン解析ツールです。NEBION社ではNCBIのGEOやEBIのArrayExpressに登録されたマイクロアレイや次世代シーケンサーの遺伝子発現データをキュレーションしています。キュレーションされた遺伝子発現データはNEBION社のサーバーに登録されます。ユーザーが解析ツールで解析を行うと、NEBION社のサーバーで検索エンジンがキュレーションされたデータから解析結果を抽出します。解析ツールはインターネット経由で検索エンジンから解析結果を受け取り画面上に表示します。
特長
- 膨大な遺伝子発現データ
公共データベースに登録された膨大なマイクロアレイや次世代シーケンサーの遺伝子発現データをキュレーションして収載しています。データベースの登録内容の詳細はこちらをご覧ください。 - 高速な検索エンジン
ゲノムワイドな数万の遺伝子発現データを解析するためにNEBION社は高速な検索エンジンを提供しています。ユーザーが検索を行うとメモリ上で高度に並列化された状態で処理されるため、複雑な検索でも短時間で検索結果が得られます。ユーザーはストレスなく様々な解析を思い通りに実行できます。 - 使いやすいインターフェース
解析ツールは分子生物学に精通した研究者が設計しており、非常に使いやすいインターフェースになっています。注目する遺伝子や組織など様々な視点で遺伝子発現データを多角的に解析できます。利用可能な解析ツールの詳細はこちらをご覧ください。 - マニュアルキュレーション
公共データベースに登録された遺伝子発現データは品質にばらつきがあり、アノテーションに不備があることも少なくありません。NEBION社では専門家がマイクロアレイやRNA-seqの遺伝子発現データを1つずつキュレーションして必要なアノテーション情報を追加しています。キューレーションの詳細はこちらをご覧ください。 - 高品質なデータ
低品質なサンプルは除外して高品質な遺伝子発現データのみ収載しています。 - データの正規化
実験ごとあるいは実験間のサンプルを比較できるようにデータを正規化しています。 - 定期的なデータ更新
常に最新の遺伝子発現データを利用できます。 - あらゆるマシンで使用可能
インターネットに接続したすべてのマシンで利用できます。Windows、macOS、Linuxに対応しています。
- Partek
- ＮＧＳ／マイクロアレイデータ解析ソフトウェア